Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
SptssbQ925E8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SptssbQ925E8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms