Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csmd1Q923L3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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