Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clip1Q922J3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clip1Q922J3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clip1Q922J3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms