Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Afg3l1Q920A7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms