Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Synpo2Q91YE8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Synpo2Q91YE8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms