Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Creb3l3Q91XE9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l3Q91XE9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms