Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac11Q91WA3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac11Q91WA3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms