Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp3Q91W36 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp3Q91W36 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms