Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc115Q8VE99 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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