Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BbxQ8VBW5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BbxQ8VBW5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms