Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Impg1Q8R1W8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Impg1Q8R1W8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Impg1Q8R1W8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Impg1Q8R1W8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Impg1Q8R1W8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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