Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec12Q8K4Q8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec12Q8K4Q8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms