Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc12Q8K2L8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms