Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacs1Q8K212 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacs1Q8K212 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacs1Q8K212 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pacs1Q8K212 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pacs1Q8K212 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms