Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q8K039 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q8K039 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q8K039 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8K039 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8K039 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8K039 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q8K039 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q8K039 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8K039 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8K039 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8K039 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8K039 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8K039 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8K039 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8K039 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8K039 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8K039 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8K039 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8K039 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8K039 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8K039 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q8K039 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms