Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nhlrc3Q8CCH2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Nhlrc3Q8CCH2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nhlrc3Q8CCH2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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