Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms