Protein–RNA interactions for Protein: Q8CA03

Slc46a2, Thymic stromal cotransporter protein, mousemouse

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Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a2Q8CA03 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Slc46a2Q8CA03 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a2Q8CA03 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Slc46a2Q8CA03 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Slc46a2Q8CA03 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc46a2Q8CA03 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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