Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp20Q8C6M1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp20Q8C6M1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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