Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C5C9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C5C9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C5C9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C5C9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C5C9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C5C9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms