Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc90bQ8C3X2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms