Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FarsaQ8C0C7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FarsaQ8C0C7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FarsaQ8C0C7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FarsaQ8C0C7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FarsaQ8C0C7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FarsaQ8C0C7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FarsaQ8C0C7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FarsaQ8C0C7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FarsaQ8C0C7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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