Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13cQ8BX70 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13cQ8BX70 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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