Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms