Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms