Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ubash3bQ8BGG7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubash3bQ8BGG7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
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Ubash3bQ8BGG7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ubash3bQ8BGG7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ubash3bQ8BGG7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubash3bQ8BGG7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ubash3bQ8BGG7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms