Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc172Q810N9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms