Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh3b1Q80VQ0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms