Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp8Q80U87 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp8Q80U87 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp8Q80U87 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp8Q80U87 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp8Q80U87 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp8Q80U87 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp8Q80U87 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp8Q80U87 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp8Q80U87 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp8Q80U87 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp8Q80U87 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp8Q80U87 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Usp8Q80U87 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp8Q80U87 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp8Q80U87 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp8Q80U87 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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