Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pja2Q80U04 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pja2Q80U04 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pja2Q80U04 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pja2Q80U04 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pja2Q80U04 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pja2Q80U04 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pja2Q80U04 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pja2Q80U04 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pja2Q80U04 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pja2Q80U04 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Pja2Q80U04 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pja2Q80U04 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms