Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrc2aQ7TSC1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms