Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms