Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms