Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nemp1Q6ZQE4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nemp1Q6ZQE4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms