Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl3Q6W5C0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms