Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdk2Q6V4S5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdk2Q6V4S5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms