Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja6Q6S5G4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gja6Q6S5G4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms