Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptx4Q6RUU0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptx4Q6RUU0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms