Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd1Q6PIP5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudcd1Q6PIP5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms