Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scaf4Q6PFF0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scaf4Q6PFF0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms