Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ6

Fbxo42, F-box only protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo42Q6PDJ6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo42Q6PDJ6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo42Q6PDJ6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms