Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slx4Q6P1D7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx4Q6P1D7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms