Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Asic1Q6NXK8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms