Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpbp1Q6NXH3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpbp1Q6NXH3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms