Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg16l2Q6KAU8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms