Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms