Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms