Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nop58Q6DFW4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop58Q6DFW4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms