Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vat1Q62465 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms