Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nptx1Q62443 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nptx1Q62443 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nptx1Q62443 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nptx1Q62443 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nptx1Q62443 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nptx1Q62443 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nptx1Q62443 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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